Сообщение было прервано в 1992 году, когда в Таджикистане началась гражданская война. 10 февраля самолет таджикской авиакомпании совершил свой первый рейс из Душанбе в Ташкент с 14 пассажирами на борту.
Авиасообщение между Таджикистаном и Узбекистаном вновь возобновилось спустя 25 лет